中科院物理研究所是以物理学基础研究与应用基础研究为主的多学科、综合性研究机构，也是北京凝聚态物理国家实验室的依托单位，以及中关村物质科学大型仪器区域中心筹建的牵头单位和北京纳米科学大型仪器区域中心的成员单位，以“面向国家战略需求，面向世界科技前沿”的战略定位，以“建成国际一流物质科学研究基地”为目标，研究方向以凝聚态物理为主，包括凝聚态物理、光学物理、原子分子物理、等离子体物理、软物质物理、凝聚态理论和计算物理等。
中科院物理研究所现有超导、磁学、表面物理3个国家重点实验室，光学物理、先进材料与结构分析、纳米物理与器件、极端条件物理、软物质物理、清洁能源前沿研究、凝聚态理论与计算7个院重点实验室，固态量子信息与计算、微加工实验室2个所级实验室，它们与国际量子结构中心、量子模拟科学中心、北京散裂中子源靶站谱仪工程中心、清洁能源中心、超导技术应用中心、功能晶体研究与应用中心等6个研究中心共同构成物理所的研究体系。

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动物研究所是中国科学院直属的以动物科学基础研究为主的社会公益型国家级科研机构，主要围绕农业、生态、环境和人类健康及其人与自然协调并存等方面的国家重大需求和重要科学问题，结合动物科学最新发展方向，通过加强传统优势学科和新型学科和技术的交叉融合，以野生动物和模式动物为研究对象，在细胞编程与重编程的机制、干细胞生物学、生殖与发育调控、生物灾害爆发机制与控制、物种濒危机制与保护和物种形成与多样性维持机制等领域开展基础性、前瞻性和战略性研究。
动物研究所服务于“生态高值农业和生物产业”、“普惠健康保障”和“生态与环境保育发展”的战略需求，在科学普及教育和科学研究领域发挥重要作用，在普及科学知识、传播先进文化、弘扬科学精神和倡导科学思维等方面，成为我国现代科学文明与创新文化的重要源泉和基地。

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成都生物研究所是以一级学科建所的中国科学院直属科研事业单位，也是中国科学院知识创新工程首批试点单位之一，以及国家天然药物工程技术研究中心、中国科学院山地生态恢复与生物资源利用重点实验室、生态保育与生物多样性保护四川重点实验室、中国科学院环境与应用微生物重点实验室、环境微生物四川省重点实验室、中国科学院四川转化医学研究医院的依托单位。
成都生物研究所设有天然产物研究中心、生态研究中心、两栖爬行动物研究室、应用与环境微生物研究中心、农业生物技术研究中心等5个研究机构，致力于生物多样性保护与生物资源可持续利用研究，为长江上游地区生态环境建设与生物多样性保护以及战略新兴生物产业的形成与升级提供科学基础、技术支撑与决策依据。

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植物研究所是隶属于中国科学院的我国植物基础科学的综合研究机构，也是中国植物学会、北京生态学会、中国植物学会植物园分会、中国花卉协会蕨类植物分会和Journal of Plant Physiology 中国编辑部的挂靠单位，主要围绕与植物学发展密切相关的国家战略需求，重点培育植物系统进化、生态环境、分子生理与发育、光合作用以及资源植物可持续利用5 个重点学科领域，力争在战略植物资源的研究和产业化示范、全球变化下的生物多样性与生态系统碳汇功能、光合作用与光能转化机理3个方面实现重大突破，引领和推动我国整合植物学的发展。
植物研究所现有7个研究和支撑部门、1个公共技术服务中心、10个野外台站、1个亚洲最大的植物标本馆和中国生态系统研究网络（CERN）生物分中心。研究和支撑部门包括系统与进化植物学国家重点实验室和植被与环境变化国家重点实验室2个国家重点实验室，中科院植物分子生理学重点实验室、中科院光生物学重点实验室、中科院北方资源植物重点实验室3个中国科学院重点实验室，以及北京植物园和文献与信息管理中心。

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中科院心理研究所是引领我国心理科学发展并有重要影响力的国际著名研究机构，也是服务于国家科技创新与城镇化发展的心理学科技智库，以及中国科学院心理健康重点实验室的依托单位，以“探索人类心智本质，揭示心理和行为的生物学基础与环境影响机制，为促进国民心理健康和推动社会和谐发展提供重要知识基础和科技支撑”为目标，建有中国科学院行为科学重点实验室，设有健康与遗传心理学、认知与发展心理学以及社会与工程心理学三个研究室。
中科院心理研究所是国务院学位委员会批准的首批博士、硕士学位授予单位，也是心理学一级学科博士和硕士学位授予单位。现有基础心理学、发展与教育心理学、应用心理学、健康心理学和认知神经科学5个博士和硕士培养点，并设有个心理学博士后流动站。
心理所现已建立了心理与行为基础数据库和心理与行为研究实验平台、心理学科研与服务信息化平台等“一库两平台”的科技支撑体系；心理所图书馆为全国馆藏最为丰富的心理学专业图书馆，藏书5万余册，可利用的心理学相关数据库超过50种；出版有我国第一本英文心理学期刊《PsyCh Journal》，及两本中文心理学期刊《心理学报》和《心理科学进展》等三本心理学学术期刊。

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广州地球化学研究所是经国家编制委员会批准，由中国科学院地球化学研究所整建制搬迁部分学科、研究室和学术带头人与原中国科学院广州地质新技术研究所合并成立的中国科学院地球化学研究所广州分部，也是社会公益类研究机构，主要研究领域包括大陆动力学与岩石圈演化、深部地质过程与地球系统变化、成矿规律与油气成藏动力学、海洋地质与边缘海演化、环境污染与控制、环境管理与可持续发展和环保技术与工程等。
广州地球化学研究所坚持面向世界科学前沿，面向国家战略需求，面向国民经济主战场，致力于推动有机地球化学、元素和同位素地球化学、环境科学、油气与矿产资源等重点学科的发展，在“资源与固体地球科学”和“环境科学与工程”两大领域开展基础性、战略性、前瞻性研究，解决国家和地方经济社会可持续发展所面临的资源和环境等重大科技问题，将广州地化所建设成为国内一流、国际知名的我国南方地球科学和环境科学研究中心。

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地球化学研究所的主体由中国科学院地质研究所从北京搬迁而来，在国内率先建立了矿床地球化学、环境地球化学、天体化学、高温高压实验地球化学、同位素地球化学、流体包裹体地球化学等地球化学学科体系；是我国首批具有博士、硕士学位授权单位、首批博士后流动站建站单位和全国一级学会—中国矿物岩石地球化学学会挂靠单位；作为主持单位取得了包括获国家自然科学一等奖在内的一系列重要学术成果；在研究所工作的11位科学家先后入选中国科学院院士。
地球化学研究所的战略定位是围绕国家战略需求和国际地球科学前沿，以地球和行星演化、地球各圈层物质循环的地球化学过程及其资源环境效应为主线，开展基础性、战略性和前瞻性研究，完善和创新地球化学理论和应用体系，提升解决我国固体矿产资源开发与生态环境治理等问题的科技支撑能力，为地球化学学科发展和国民经济建设作出重要贡献，成为我国地球和行星演化、固体矿产资源与喀斯特生态环境研究的重要基地及地球化学优秀人才的培养摇篮。

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化学研究所是直属于中国科学的一家以基础研究为主，有重点地开展国家急需的、有重大战略目标的高新技术创新研究，并与高新技术应用和转化工作相协调发展的多学科、综合性研究所，也是具有一定国际影响、我国最重要的化学研究机构之一，现有3个国家重点实验室，8个中国科学院重点实验室，1个所级实验室（中国科学院先进高分子材料创新工程中心），1个分析测试中心。
化学研究所的主要学科方向为高分子科学、物理化学、有机化学、分析化学、无机化学。面向世界科技前沿，化学所坚持科学技术的原始创新；面向国家战略需求，面向国民经济主战场，化学所不断加强高技术创新和集成,高度重视化学与生命、材料、环境、能源等领域的交叉，在分子与纳米科学前沿、有机高分子材料、化学生物学、能源与绿色化学领域取得新的突破，建设和完善面向国家重大战略需求的先进高分子材料基地。

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草原研究所是直属于中国农业科学院的我国草学研究的国家级研究所，位于内蒙古自治区首府呼和浩特市赛罕区乌兰察布东街120号，以我国4亿公顷草地的繁荣为己任，在草地资源、生态，牧草育种、生产加工，区域可持续发展等领域开展科学技术研究和攻关，致力于引领草学研究，解决草原生产、保护中存在的科学问题，为国家生态、食品安全以及新农村、新牧区建设提供科技支撑。
草原研究所作为一家条件齐备、实力雄厚、成果卓著、优势明显的国家级草原综合研究所，拥有部级野外观测台站3个、院级野外观测台站5个，占地1422公顷，分布于高寒草原、荒漠草原、典型草原、沙地草原、农牧交错区、农区等不同草原类型和区域，以打造领先、创新的科研条件平台为目标，建立了试验设备先进、科研团队结构合理、“开放、流动、联合、竞争”的农业部牧草资源与利用重点实验室，并拥有国家牧草种质资源中期保存库、国家种质多年生牧草圃、农业部草业产品质量安全监督与检测中心、农业部农业遥感应用中心呼和浩特分中心、农业部草原畜牧业装备技术试验站等科研创新平台，致力于成为国内一流、国际有影响力的现代研究所。

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浙江亚热带作物研究所位于温州景山，是专业从事我国中、南亚热带地区经济植物资源研究与开发的区域性综合型研究所，主要研发领域包括花卉、中药材、果树、丛生竹与经济林、林业生态、药用真菌、植物保护、植物引种与驯化、食用菌、园林景观设计与工程，下设花卉资源与育种研究室、花卉栽培研究室（花卉开发中心）、经济植物研究室（药用植物与果树研究室）、林业与生态研究室、虫生真菌利用与植物保护研究室、分析检测中心、马站试验站7大研发处室。
浙江亚热带作物研究所秉承“立足温州，服务浙江，面向全国，跟踪国际”宗旨，建立了农业部新农药田间药效试验认证单位、浙江省药用植物重点实验室、浙江省花卉区域科技创新服务中心、浙江省农科院亚热带植物种质创新与利用重点实验室、温州市虫生真菌资源研究与开发重点实验室、温州市花卉科技创新服务中心、浙南土壤与植化检测中心、亚热带植物种质资源圃等科技创新平台；拥有中高档花卉经营、园林绿化工程、新资源食品、林业规划设计四大主导科技产业，以及温州市农业高新园区亚热带植物种苗创新基地（中高档花卉科技示范基地）、景山亚热带特色绿化苗木基地、瓯海高山花卉培育基地、苍南马站特色苗木繁育基地四大产业化开发基地。

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